可以通过鸣声来辨别企鹅的性别。

雌雄企鹅的鸣声有区别。在它们相互鞠躬点头，磨嘴从事求情表演的时候，用录音机记录它们的鸣声。脉冲较长150至500毫秒，被判断为雄性，脉冲较短30至100毫秒，被判断为雌性。产卵者的脉冲较短。 不仅成年鸟如此，未成年鸟在半岁左右也具有发出这种鸣声的能力。

目前还难以分辨幼年企鹅的性别。 此方法来辨认企鹅的雌雄，存在一定的漏洞和问题，在实际工作中，科学工作者经过观察研究，对每个企鹅都采用不同的颜色组合作为编号，标记在企鹅的鳍脚翅膀上，由此易分出企鹅