生物多样性减少有自然原因和人为原因两方面。人类活动是生物多样性的损失的最主要原因。

自然原因：

1、物种本身的生物学特性，物种的形成与灭绝是一种自然过程；物种对环境的适应能力或变异性、适应性比较差，在环境发生较大变化时难以适应，因此而面临灭绝的危险；

2、环境突变自然灾害。

人为原因：

1、人类对生物多样性对人类的重要性认识不足，同时过多重视经济发展，对生物多样性保护意识淡薄；

2、生物资源开发过度，有些甚至为掠夺式的开发；