商业房屋贷款和公积金贷款的区别有：

1、公积金贷款利率优惠，同样贷款金额和还款年限，公积金贷款与商业贷款相比能节省数万元利息。公积金贷款还款更加方便灵活，公积金贷款对所购房产的限制性更小；

2、商业房屋贷款受限条件少、还款形式多样，商业贷款对于贷款人是否缴存住房公积金没有限制，只要首付达到银行要求的比例，具有良好的信用额度即可申请贷款，申请程序相对简单。

住房公积金贷款是指由各地住房公积金管理中心运用职工以其所在单位所缴纳的住房公积金，委托商业银行向缴存住房公积金的在职职工和在职期间缴存住房公积金的离退休职工发放的房屋抵押贷款。商业贷款又称个人住房贷款，是中国人民银行批准设立的商业银行和住房储蓄银行，为城镇居民购买自用普通住房提供的贷款，执行法定贷款利率。商贷的劣势在于其不菲的利息，由于商贷的利率较高，产生的房贷利息也居几种房贷之首。这也是两者区别的地方。