六库镇地处云南省怒江傈僳族自治州州府和泸水市政府所在地，也是地跨高黎贡山东麓至碧罗雪山西麓的两岸，它东与老窝镇相邻，西与缅甸接壤，北接鲁掌镇，南至上江镇。全镇总面积376平方千米，境内山高谷深、沟壑纵横，最高海拔3100米，最低海拔800米。

年平均降雨量1115毫米，年平均气温23℃，属典型的亚热带山地立体气候，山势总体呈“凹”字型，东西高，中间低，形成高山寒冷，半山温凉，沿江地带炎热，全镇森林覆盖率为56%。