A与T或A与U之间是两个氢键，G与C之间是三个氢键。

氢原子与电负性大、半径小的原子X以共价键结合，若与电负性大的原子Y接近，在X与Y之间以氢为媒介，生成一种特殊的分子间或分子内相互作用，称为氢键。

2013年11月22日，中科院国家纳米科学中心宣布，该中心科研人员在国际上首次拍到氢键的照片，实现了氢键的实空间成像，为氢键的本质这一化学界争论了80多年的问题提供了直观证据。这不仅将人类对微观世界的认识向前推进了一大步，也为在分子、原子尺度上的研究提供了更精确的方法。