苏丹分裂主要是达尔富尔问题。

由于苏丹边界是19世纪欧洲列强瓜分非洲和实行殖民统治时人为划定，达尔富尔地区不少部落曾被划到不同的国家，因而该地区的部族与周围邻国有着千丝万缕的联系。近年来，随着达尔富尔地区石油等矿产资源不断被开发，部族之间为争夺资源的斗争日趋激烈，一些邻国也以各种形式卷入其中。

2003年2月，达尔富尔地区黑人居民相继组成 “苏丹解放军”和“正义与平等运动”2支武装力量，以政府未能保护土著黑人的权益为由，要求实行地区自治，与政府分享权力与资源，并不断攻城略地，展开反政府武装活动。

2011年2月7日，苏丹正式宣布苏丹南部公投的最终结果，98、83%的选民支持南部地区从苏丹分离。苏丹总统巴希尔宣布承认和接受苏丹南部公投的最终结果。