如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)
如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)
2024-06-25 10:26:19  作者:向语歌  网址:https://m.xinb2b.cn/sport/yed120956.html

Pubmed 是我们最常用的检索数据库,很多小伙伴都会用,但是能不能用好又是另外一回事了,当你用 Pubmed 进行检索的时候,可能会得到很多文献,上千上万篇的文献到底哪些是自己需要的呢?

我们常规的方法是通过增加或变化检索词、限制检索条件来进行筛选,但是到底改变哪些检索词更有效可能很多人不清楚。

今天就给大家介绍一个工具:PubReminer

这个工具是一个 Pubmed 资料分析工具,不仅可以汇总分析 PubMed 查询结果提高查询效率,另外还可以为论文选择可投期刊查找某一研究领域的专家,并且还可以确定某一专家的研究方向

下面跟我一起来体验下这个工具吧:

官方网址:

https://hgserver2.amc.nl/cgi-bin/miner/miner2.cgi

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(1)

PubReminer 的检索区域包括:检索输入框、条件限制、检索结果显示数量和基因检索。可以在检索框中直接输入检索式,如果不会自己写,你可以利用 PubMed 的高级检索方法,把最后得到的检索式 Copy 到 PubReminer 中就行了。

下面举个例子

比如我们想找下冠状病毒治疗的相关文献,我们在 Pubmed 高级检索中得到下面方框中的检索式。

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(2)

我们把这个检索式 copy 到 PubReminer 中

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(3)

因为我们在 Pubmed 中已经知道有 928 篇文献,所以显示检索数量可以不修改你,默认就是最多显示 1000 篇,如果你检索的结果超过了 1000 篇,可以在这里修改显示数量,最多不能超过 10000 篇。

我们点击 Start PubReMiner,开始会有一个等待的过程,网站需要花一点时间去分析处理,等待时间有个红框显示。

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(4)

分析完成后我们可以看到下面的结果,把文献按照不同的条件进行了分类,如年代、杂志、作者、关键词、主题词、物质、发表形式,每一组都按照降序排列。

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(5)

如果不想显示某些条件分析的结果,可以在右边把某些分类的勾去掉,然后点击 Search with Manual Adjustment

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(6)

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(7)

通过上面的结果,我们可以看到发表杂志最多的是 Journal of Virology。

此时可以选择相应的限制条件,如选中某些期刊,或者还可以加上某些作者,或者加上一些关键词(Word),通过 Operator 下拉列表中的 AND 还是 NOT 增加检索词或者排除某些结果,这样可以更能缩小检索结果,比 PubMed 更直观、有效。

比如这个例子我只想看前 2 个杂志的文章,那么勾选前面 2 个杂志,Operator 选择 AND,点击 Search Again

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(8)

点击后就会只显示这 2 个杂志的文献分析结果,我们可以放心检索框中的检索式已经改变,点击 Goto Pubmed with query 我们会回到 Pubmed 的界面。

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(9)

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(10)

我们在投稿时有些杂志要求作者提供审稿人,可以根据 PubReMiner 的检索结果进行查找相关的专家。在作者一栏还可以看到发表文献最多的作者是 ZHANG J,如果想了解一下这位作者的全部研究,勾选后点击 Search Again,只看其研究,然后可以点击 Goto Pubmed with query 回到 PubMed 看到作者所有发表的相关文献。

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(11)

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(12)

除了检索文献,PubReminer 还可以检索基因,但是有时候比较卡,可能会出现白屏打不开的情况,你们可以自己试试。

如何使用pubmed检索目标文献(如何在浩瀚的Pubmed中快速找到自己需要的文献)(13)

总的来说 PubReminer 是一个不错的分析工具,总结有以下几个优点:

1. 帮助我们快速筛选 Pubmed 得到的结果,通过各种分类缩小范围满足我们的需要;

2. 可以快速掌握一个领域的研究趋势,根据发表年代的文献数量,看出这方面的研究是增加还是在减少,以此确定你的方向是不是研究热点,简直是开题神器;

3. 根据得到的杂志排名,找到发表此类文献最多的期刊,我们投稿的时候可以选择这些期刊;

4. 根据作者信息,可以找到此类研究最多的大牛是谁,如果想外出深造,当然首选此类大牛,出研究成果的机率也就大大的增加;

5. 免费的,随便用,这个是关键。

文章来源:逍遥君自习室

  • 摩羯能斗得过双子吗(当摩羯遇上双子)
  • 2024-06-26当摩羯遇上双子土象星座的摩羯和风象星座的双子,前途不甚乐观,阴阳两地,本就是两个不同的极端,况且还是距离最远的顶点;双子对爱情的态度是“不在乎天长地久,只要求曾经拥有”而摩羯最是不喜这种为了恋爱而恋爱人,对此感到痛。
  • 三星堆的模样是什么样的(三星堆的神秘面纱)
  • 2024-06-26三星堆的神秘面纱综合新华社报道黄金面具、青铜人像、青铜尊、玉琮、玉璧、金箔、象牙……20日,“考古中国”重大项目工作进展会在成都举行,通报了四川广汉三星堆遗址重要考古发现与研究成果新发现的6座三星堆文化“祭祀坑”,目。
  • 怎样蒸鸡蛋(如何蒸鸡蛋)
  • 2024-06-26如何蒸鸡蛋主料:鸡蛋300克调料:盐2克、味精1克、酱油1克、小葱15克,各适量将鸡蛋打碎在小盆里,放少许盐和味精,用筷子打匀然后一边加水,一边继续用筷子搅拌水最好是隔夜的热水或是温开水,喜欢吃硬一些的,可以少。
  • 懒人版鸡蛋饼的做法(鸡蛋饼简单做法)
  • 2024-06-26鸡蛋饼简单做法把鸡蛋,盐,油,水加在一起打至盐溶化,慢慢加面粉搅和,面粉有疙瘩就用小勺压,最后加荵花搅拌至完全没有面疙瘩然后放一旁醒几分钟开中火,用平底不粘锅,在锅里倒一点油,把面糊从中间倒下去,调好后的面糊一倒下。
  • 司马懿在三国演义里的地位(为什么他演的司马懿如此传神)
  • 2024-06-26为什么他演的司马懿如此传神央视的《三国演义》电视剧中有很多经典角色,比如唐国强的诸葛亮,陆树铭的关羽等,都是演得非常好其中魏宗万演的司马懿也是相当传神,他把司马懿的老谋深算和忍辱负重都演了出来,剧中很多镜头都能看出他的演技在魏。
  • 为什么打不过他就弄瞎他(怎么办我知道他在哪)
  • 2024-06-26怎么办我知道他在哪背身打了半天没打死,被人回身一枪爆了头,气不气?面对面打完一弹匣,互相低头换弹夹,尴尬不尴尬?老铁,该练枪了!众所周知,CSGO有众多地图供玩家选择,它们分别是dust2,dust2,dust2,du。
  • 贵州人豆渣怎么做好吃(三明人佳作齐分享)
  • 2024-06-26三明人佳作齐分享来源:三明日报游浆豆腐●宁江炳儿时家穷,每到年关,父亲到集市上买回几斤猪肉、两副对联、一串鞭炮,这便是过年简单而丰富的年货煎糍的糯米和油是生产队里分的,年夜饭我和哥哥“扛”的鸡腿是母亲养的,萝卜白菜大。
  • 人生幸福的定义是什么(什么是幸福)
  • 2024-06-26什么是幸福其实幸福很简单,幸福就是双手还能动,幸福就是双脚还能走,幸福就是脑子还能想等等的最基本生活体制,也就是只要人活着就是幸福当我们每天爬起床,张开双眼,能看到窗外的阳光,这就是幸福;当我们每天吃饭的时候,。
  • 新年的每一天都温暖又开心(一词话新春活力)
  • 2024-06-26一词话新春活力瑞兔迎春,九州欢腾春节既承载中华民族的古老传统也呈现今日中国的生机画卷1月24日,民俗表演队伍在安徽省合肥市肥西县三河古镇的“民间文化艺术节”活动上表演舞龙新华社发(徐勇摄)浓浓年味穿越古今闹新春、看。
  • 即将失传的传统戏曲文化(古老语言的低低呼唤---戏曲文化)
  • 2024-06-26古老语言的低低呼唤---戏曲文化我曾在学堂上用字典细细查阅过“阳春白雪”与“下里巴人”的意思,当时不甚理解,也曾请教过老师,言:“阳春白雪”为高雅的艺术,古时王公贵族才能欣赏的表演而“下里巴人”则为普通老百姓喜闻乐见的“社戏”,在我。
  • 梁启超评价李鸿章(李鸿章的功过向来褒贬不一)
  • 2024-06-26李鸿章的功过向来褒贬不一天下之有庸常之辈既不会受到责备,也不会受到赞誉如果一个人能让全天下的百姓都恨他,那么他就可以称得上是超乎寻常的奸雄;如果一个人能让全天下的百姓都赞赏他,那么他则可以称得上是超乎寻常的豪杰虽然天下有很多。