多囊卵巢综合征是具有多基因遗传倾向的代谢性疾病。根据现代医学观点，多囊卵巢综合征被认为是由多个病因引起的共同表现，可能是精神、心理因素与环境因素及药物因素共同作用的结果。
1、遗传因素：多囊卵巢综合征基因呈Ｘ连锁显性遗传或常染色体显性遗传，但不完全遵守孟德尔遗传定律。相关基因分为高雄激素相关基因和胰岛素受体相关基因。
2、环境因素
A、饮食结构与生活方式
多囊卵巢综合征患者中，约30％合并肥胖，正常体重女性多囊卵巢综合征发生率仅为5％，肥胖型多囊卵巢综合征患者较非肥胖型多囊卵巢综合征患者存在更严重的内分泌及代谢紊乱。
B、激素暴露
胚胎时期：胚胎时期暴露于高雄激素的女性患儿，可能出现一系列内分泌及生殖功能改变，而最终导致多囊卵巢综合征。幼儿时期：低出生体重儿在其早期生长赶超阶段，导致早期胰岛素抵抗状态发生，可能进而导致其性早熟及青少年时期的高雄激素症状，最终导致成年女性发生多囊卵巢综合征。
3、下丘脑垂体-卵巢功能异常
4、胰岛素抵抗与高胰岛素血症
5、精神和心理因素
6、药物因素
